http://www.grzenow.com/pl/tags/cuda/Recent content in CUDA on grzenowHugoplTue, 25 Jun 2024 00:00:00 +0000http://www.grzenow.com/pl/projects/hpc-projects/Tue, 25 Jun 2024 00:00:00 +0000http://www.grzenow.com/pl/projects/hpc-projects/<p>Podczas pierwszego roku studiów magisterskich uczęszczałem na przedmiot &ldquo;Obliczenia superkomputerowe&rdquo;, podczas którego napisałem dwa ciekawe projekty: jeden z wykorzystaniem CUDA, a drugi z użyciem MPI.</p> <h3 id="dopasowywanie-w-bazie-danych-wariantów-genomowych"> Dopasowywanie w bazie danych wariantów genomowych <a class="heading-link" href="#dopasowywanie-w-bazie-danych-wariant%c3%b3w-genomowych"> <i class="fa-solid fa-link" aria-hidden="true" title="Link to heading"></i> <span class="sr-only">Link to heading</span> </a> </h3> <p>Celem było stworzenie systemu dopasowywania wariantów genomowych z pliku do bazy danych (dbNSFP). Rozwiązanie składa się z dwóch etapów: indeksowania bazy danych i dopasowywania, przy czym dopasowywanie zostało zoptymalizowane za pomocą CUDA.</p>